Hola Carlos, si aún no has reservado el viaje, primero de todo te recomendaría pasar más días en Lanzarote, tiene más para ver, aunque realmente te quedarás corto en días. En cuanto a playas en Fuerteventura hay playas espectaculares, pero creo que hace más viento que en Lanzarote (aunque las canarias es lo que tienen...)
Es muy probable que la mayoría de compañías no te permitan alquilar un coche en una isla y devolverlo en otra, de todas formas te saldría mucho más cara esta opción ya que no es lo mismo pagar ferry para pasajeros que para pasajeros + coche.
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Otra cosilla en Fuerteventura hay algunas zonas que solo hay caminos de arena, se pasa bien con un coche normal, pero las compañías te avisan que no se hacen cargo si te quedas tirado vaya...
Un Saludo,
¡Que disfrutes de tus vacaciones!
Oscar.